Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snrnp35Q9D384 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snrnp35Q9D384 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Snrnp35Q9D384 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snrnp35Q9D384 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms