Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramef12Q9D2F1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramef12Q9D2F1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramef12Q9D2F1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms