Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lingo1Q9D1T0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lingo1Q9D1T0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lingo1Q9D1T0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lingo1Q9D1T0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lingo1Q9D1T0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms