Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cysrt1Q9D1E4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cysrt1Q9D1E4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cysrt1Q9D1E4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cysrt1Q9D1E4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cysrt1Q9D1E4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms