Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Susd3Q9D176 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Susd3Q9D176 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Susd3Q9D176 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Susd3Q9D176 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms