Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
3100002H09RikQ9CXW6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
3100002H09RikQ9CXW6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3100002H09RikQ9CXW6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
3100002H09RikQ9CXW6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.1 ms