Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sgo1Q9CXH7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sgo1Q9CXH7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sgo1Q9CXH7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sgo1Q9CXH7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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