Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yif1bQ9CX30 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Yif1bQ9CX30 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Yif1bQ9CX30 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms