Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RpainQ9CWY9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RpainQ9CWY9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RpainQ9CWY9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RpainQ9CWY9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms