Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx2Q9CWK8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx2Q9CWK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx2Q9CWK8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx2Q9CWK8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx2Q9CWK8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms