Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpidQ9CR16 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpidQ9CR16 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpidQ9CR16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms