Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psmd9Q9CR00 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd9Q9CR00 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd9Q9CR00 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms