Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV4

Retreg3, Reticulophagy regulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg3Q9CQV4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retreg3Q9CQV4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retreg3Q9CQV4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retreg3Q9CQV4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg3Q9CQV4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms