Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mri1Q9CQT1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mri1Q9CQT1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mri1Q9CQT1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mri1Q9CQT1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms