Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Riok2Q9CQS5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Riok2Q9CQS5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok2Q9CQS5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok2Q9CQS5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms