Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpa3Q9CQ71 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpa3Q9CQ71 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpa3Q9CQ71 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms