Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl49Q9CQ40 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl49Q9CQ40 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl49Q9CQ40 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl49Q9CQ40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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