Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chmp3Q9CQ10 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chmp3Q9CQ10 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Chmp3Q9CQ10 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chmp3Q9CQ10 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms