Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms