Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12aQ99PQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim12aQ99PQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim12aQ99PQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim12aQ99PQ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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