Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930550L24RikQ99PA7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930550L24RikQ99PA7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930550L24RikQ99PA7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930550L24RikQ99PA7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms