Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac9Q99N13 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac9Q99N13 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac9Q99N13 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac9Q99N13 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hdac9Q99N13 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac9Q99N13 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms