Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd3Q99MJ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdzd3Q99MJ6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdzd3Q99MJ6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzd3Q99MJ6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdzd3Q99MJ6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzd3Q99MJ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms