Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkd1Q99MH6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkd1Q99MH6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nkd1Q99MH6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms