Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q99LU8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q99LU8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q99LU8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q99LU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q99LU8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99LU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99LU8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99LU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99LU8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q99LU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99LU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99LU8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99LU8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99LU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99LU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99LU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99LU8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q99LU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99LU8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99LU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99LU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99LU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99LU8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99LU8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q99LU8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q99LU8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99LU8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99LU8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99LU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99LU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99LU8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q99LU8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99LU8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99LU8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99LU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q99LU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99LU8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99LU8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99LU8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q99LU8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99LU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99LU8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99LU8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99LU8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99LU8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99LU8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99LU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q99LU8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99LU8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99LU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99LU8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99LU8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99LU8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99LU8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99LU8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99LU8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q99LU8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99LU8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99LU8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99LU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99LU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q99LU8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99LU8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99LU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99LU8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99LU8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99LU8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q99LU8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99LU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99LU8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q99LU8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99LU8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99LU8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99LU8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99LU8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99LU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99LU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99LU8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99LU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q99LU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99LU8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99LU8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99LU8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q99LU8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99LU8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99LU8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q99LU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99LU8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99LU8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q99LU8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms