Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GatbQ99JT1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GatbQ99JT1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GatbQ99JT1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms