Protein–RNA interactions for Protein: Q99J85

Nptxr, Neuronal pentraxin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NptxrQ99J85 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NptxrQ99J85 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NptxrQ99J85 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NptxrQ99J85 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NptxrQ99J85 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NptxrQ99J85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NptxrQ99J85 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NptxrQ99J85 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NptxrQ99J85 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms