Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Apobec3Q99J72 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apobec3Q99J72 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apobec3Q99J72 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms