Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Derl1Q99J56 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Derl1Q99J56 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl1Q99J56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms