Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nrbp1Q99J45 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nrbp1Q99J45 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nrbp1Q99J45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nrbp1Q99J45 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nrbp1Q99J45 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrbp1Q99J45 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nrbp1Q99J45 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nrbp1Q99J45 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms