Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc8b1Q925Q3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc8b1Q925Q3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc8b1Q925Q3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc8b1Q925Q3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms