Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim66Q924W6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim66Q924W6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim66Q924W6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim66Q924W6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms