Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prss28Q924N9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss28Q924N9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Prss28Q924N9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss28Q924N9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms