Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp4Q921I6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp4Q921I6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp4Q921I6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp4Q921I6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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