Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msi2Q920Q6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msi2Q920Q6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msi2Q920Q6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms