Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx18Q91ZR2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx18Q91ZR2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx18Q91ZR2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snx18Q91ZR2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms