Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg13Q91YI1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg13Q91YI1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg13Q91YI1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg13Q91YI1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg13Q91YI1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms