Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha5Q91Y15 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha5Q91Y15 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha5Q91Y15 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha5Q91Y15 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms