Protein–RNA interactions for Protein: Q91XA5

Snapc2, snRNA-activating protein complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc2Q91XA5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snapc2Q91XA5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snapc2Q91XA5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snapc2Q91XA5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snapc2Q91XA5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snapc2Q91XA5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snapc2Q91XA5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snapc2Q91XA5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms