Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp9Q91WM3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrp9Q91WM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp9Q91WM3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp9Q91WM3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp9Q91WM3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Rrp9Q91WM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp9Q91WM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rrp9Q91WM3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp9Q91WM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp9Q91WM3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms