Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx9Q91VH2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx9Q91VH2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx9Q91VH2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx9Q91VH2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms