Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mark1Q8VHJ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mark1Q8VHJ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark1Q8VHJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mark1Q8VHJ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms