Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt79Q8VED5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt79Q8VED5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krt79Q8VED5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt79Q8VED5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1830.5 ms