Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Cul7Q8VE73 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35,59■■■■□ 3,29
Cul7Q8VE73 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Cul7Q8VE73 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35,57■■■■□ 3,29
Cul7Q8VE73 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35,55■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Cul7Q8VE73 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35,49■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35,49■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Cul7Q8VE73 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Cul7Q8VE73 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35,43■■■■□ 3,26
Cul7Q8VE73 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35,43■■■■□ 3,26
Cul7Q8VE73 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Cul7Q8VE73 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Cul7Q8VE73 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35,42■■■■□ 3,26
Cul7Q8VE73 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Cul7Q8VE73 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Cul7Q8VE73 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Cul7Q8VE73 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Cul7Q8VE73 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Cul7Q8VE73 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35,23■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35,2■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Cul7Q8VE73 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cul7Q8VE73 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Cul7Q8VE73 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Cul7Q8VE73 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Cul7Q8VE73 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,1 ms