Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Cul7Q8VE73 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cul7Q8VE73 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cul7Q8VE73 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cul7Q8VE73 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Cul7Q8VE73 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Cul7Q8VE73 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cul7Q8VE73 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cul7Q8VE73 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Cul7Q8VE73 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cul7Q8VE73 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cul7Q8VE73 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cul7Q8VE73 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cul7Q8VE73 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cul7Q8VE73 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cul7Q8VE73 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cul7Q8VE73 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms