Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab3il1Q8VDV3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab3il1Q8VDV3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3il1Q8VDV3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab3il1Q8VDV3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab3il1Q8VDV3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab3il1Q8VDV3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms