Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Fyco1Q8VDC1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Fyco1Q8VDC1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fyco1Q8VDC1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fyco1Q8VDC1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Fyco1Q8VDC1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fyco1Q8VDC1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Fyco1Q8VDC1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fyco1Q8VDC1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fyco1Q8VDC1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Fyco1Q8VDC1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fyco1Q8VDC1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Fyco1Q8VDC1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.5 ms