Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd300ldQ8VCH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd300ldQ8VCH2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd300ldQ8VCH2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300ldQ8VCH2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms