Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Dnajc28Q8VCE1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnajc28Q8VCE1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajc28Q8VCE1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajc28Q8VCE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms