Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top1mtQ8R4U6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top1mtQ8R4U6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top1mtQ8R4U6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Top1mtQ8R4U6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms