Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup35Q8R4R6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup35Q8R4R6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup35Q8R4R6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup35Q8R4R6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup35Q8R4R6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms